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In den Mühlhäuser Beiträgen erscheinen regelmäßig auch naturwissenschaftliche Veröffentlichungen. Die Hefte sind z.T. noch lieferbar.Bisher erschienen sind:

Hertzel, Gerhard:
- Ein Fundort des seltenen Schneckenkankers Ischyropsalis hellwigi (Panzer, 1974) bei Mühlhausen/Thür. (Opiliones, Ischyropsalididae) (16/93)
Hummel, Manuel: - Die Mühlhäuser Museen und der Nationalpark Hainich - Eine Standortbestimmung (22/99) - Neues vom Hainich (22/99)
- Eine Großtrappe und Großtrappeneier (23/2000)
Patzelt, Gerald:
- Beobachtungen zur Fossilisation von Germanonautilus (Nautiliden, Mitteltrias) (18/95)
- "Der Mühlhäuser Stadtwald" - Sonderausstellung im Museum am Lindenbühl (18/95)
- Der mittlere Wellenkalk und der Bereich der Terebratelbänke in Nordwest-Thüringen (19/96)
- Lagerungsverhältnisse und Oberflächenformen bei Treffurt (20/21/97/98)
- Eine geologische Revisionskartierung im Bereich der Eichenberg- Saalfelder Störungszone nordwestlich von Lengenfeld unterm Stein (Eichsfeldkreis) (22/99)
- Ein als Naturdenkmal vorgesehener Geotop bei Misserode im Eichsfeldkreis (23/2000)
- Schnecken und Muscheln der Weltmeere. Mühlhäuser Museumshefte 2/96
Reuther, Rolf:
- Halophytenstandorte im Bereich der Rückstandshalden der stillgelegten Kalischachtanlagen in Volkenroda und Pöthen (19/96)
- Beobachtungen zur Ausbreitung von Neophyten in der Flora von Mühlhausen und seiner Umgebung in den vergangenen Jahrzehnten (23/2000)
Tillich, Hans-Jürgen:
- Der botanische Garten Mühlhausen (15/92)
- Das Alter der "1000jährigen" Eiche bei Volkenroda / Unstrut-Hainich-Kreis (18/95)
Weise, Ralf & Reinhard Stollberg:
- Die Vogelwelt an den Gewässern des Kreises Mühlhausen. Überblick und Veränderungen (13/90)
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